开篇小剧场
在家里，蓝格雷看着电视，随后门铃响了，蓝格雷开了门，是巧回来了。蓝格雷问巧他另一个世界的情况，巧说那个世界和这里一样，一样有真嗣他们，一样有EVA和使徒，唯一的不同点就是时间，这里是2021，而那里是2020，但是这个不同点没有一点用，还是不知道那个世界的使徒怎么来到这的。
巧：那个世界的EVA驾驶员们完全不知道最终号机，而使徒也没有穿越时空的能力，唉，到底是怎么来的啊。
巧陷入沉思......
正篇开始
真嗣离开了审讯室，明日香依然没有停下问绫波的去向，认为她一定还在初号机的插入栓内，赤木告诉明日香说他们已经把初号机的内部完完全全的检查了多遍，绫波不在里面，最后只发现了昏迷的明日香和一个不知道为什么没有坏的随身听。
明日香拿起随身听，回想起救绫波的场景，记得那时绫波是拿着随身听的，她更坚定的认为绫波还活着。这时突然发生震荡，审讯室响起警报，美里接到消息，说目标出现在后甲板。
美里：吼？主角登场了啊。
美里下令全员第一战斗准备，以保护初号机为最优先命令。在走廊抽着烟的真嗣收到消息，把烟扔到地上踩了一脚掐断烟头，然后拿出手机打给真希波。
真嗣：喂，猫女，主角登场了，八号机现在总能动了吧。
真希波：可以了大少爷，现在就在准备着，对了，大小姐怎么样了。
真嗣：大小姐？你说明日香？她现在就一丫头，完全没有用。比起这个，还不赶紧给我出击！
真希波：是是是，大少爷，喵~
明日香问美里发生了什么事，是不是有使徒入侵，一直叫喊着，但是没有人回应，这时明日香听到了绫波的声音。
“明日香，你在哪里？”